Tradicionalmente o comércio rondonopolitano sempre foi o mais pujante do interior de Mato Grosso, sendo referência para moradores das regiões sul e sudeste do Estado e de algumas cidades do norte de Mato Grosso do Sul e sudoeste de Goiás. As grandes redes do varejo nacional estão cada vez mais presentes no comércio local. Por sua vez, as grandes empresas do varejo local não ficam por menos e grandes lojas, de vários ramos, atendem à população em geral.
Em 2017, o comércio local foi o setor com o maior saldo de empregos formais, segundo o Cadastro Geral de Empregados e Desempregados (Caged), com 556 vagas criadas. O comércio varejista também, segundo dados da 7ª edição do Perfil Rondonópolis, produzido pela Associação Comercial (ACIR), era o setor que mais gerava empregos na cidade, com 13.532 empregados em 2016.
A cidade é sede, desde 2001, do maior shopping center do interior do Estado, contando com praça de alimentação, parque infantil, mix variado de lojas e três salas de cinema.
